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SARS-CoV-2和COVID-19傻傻分不清?病毒命名到底有啥讲究

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发表于 2020-3-9 12:04:42 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式

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https://new.qq.com/omn/20200307/20200307A0ENIT00.html
较真要点:
  • 1通常来说,病毒的命名基于病毒本身的遗传信息和结构,目的是为了更好地促进诊断方法、疫苗或者药品的研发过程。疾病的命名则是为了更方便地讨论疾病的预防、传播、严重性和治疗等问题。
  • 2按照目前的规定,国际病毒分类委员会负责一种新病毒的分类与命名,而世界卫生组织负责该病毒引起的新疾病的命名。当前国际病毒分类委员会将新型冠状病毒的病毒名为SARS-CoV-2,其引起的疾病则被世界卫生组织命名为COVID-19。
  • 3基于新病毒名SARS-CoV-2会对公众产生误导等一系列原因,我国学者呼吁将新冠病毒改名为HCoV-19。但是国际病毒分类委员会3月2日发表了最新的声明,表示新病毒的命名考量了新冠病毒和SARS病毒的遗传相似性,是基于系统发生学,遗传分类学和现有命名体系的基础上的,SARS-CoV-2已经确定是新冠病毒的名字。
查证者:韩越丨剑桥大学病毒学博士后

                               
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3月2日,国际病毒分类委员会(International Committee on Virus Taxonomy,ICTV)冠状病毒研究小组在学术期刊Nature Microbiology上发表新的学术论文,就目前有争议的新冠病毒命名问题进行了解答。文章的核心观点为:新冠病毒与以SARS-CoV为原型的同种病毒具有遗传相似性,基于系统发生学、遗传分类学和现有命名体系,将新冠病毒命名为“严重急性呼吸综合征冠状病毒2”(SARS-CoV-2)。
新型冠状病毒的命名不是早已确定了吗?“争议”又是怎么来的?这还要从新冠病毒的命名史说起。
一、新冠病毒现在到底叫啥名,你能一秒答上来吗?
从疫情爆发开始,笔者每天都在关注疫情的最新进展,新闻报道和专业文献里提及新冠病毒的部分会出现很多不同的名字:武汉肺炎、新型冠状病毒、2019-nCoV、Novel coronavirus pneumonia (NCP), COVID-19,还有SARS-CoV-2。相信很多人一定有这样的困惑,一个病毒为什么会有这么多名字?其实这些名字中既包括了这次新型病毒的名字,也包括了新型病毒所导致疾病的名字。病毒和疾病的名字掺杂在一起,可能是很多人感到困惑的最主要原因。
我们不妨先来看一下这些名字出现的先后顺序:2019年12月末,媒体开始第一次报道武汉开始出现不明原因的肺炎,报道中描写这次疾病时,一般用“武汉肺炎”来描述。1月初,引起疾病的新型病毒被第一次分离,是一种我们之前没有发现过的冠状病毒,因为还没有合适的名字,很多报道中用新型冠状病毒,或者新冠病毒的简称来描述这个新发现的病毒。这个时期,也有人用SARI(Severe Acute Respiratory Infection,严重急性呼吸感染病例)来代指新冠病毒,但是后来被证实这是不准确的描述。
2020年1月30日,世界卫生组织(WHO)建议用2019-nCoV来临时命名这次的新型病毒,其实2019代表病毒出现的年份,n代表新发,CoV代表冠状病毒,而病毒所导致的疾病被临时命名为“2019-nCoV急性呼吸疾病”。2月8日,国家卫健委发布通知,称暂时将此次的疾病命名为“新型冠状病毒肺炎”,简称“新冠肺炎”,英文Novel coronavirus pneumonia (NCP)。
2月11日,WHO宣布将此次新型疾病更名为COVID-19,其中CO代表冠状,VI代表病毒,D代表疾病。同一天,国际病毒分类委员会(International Committee on Virus Taxonomy,ICTV)提议根据生物遗传学进行分析,因为新型冠状病毒和SARS有较近亲缘关系,将此次的新型病毒命名为SARS-CoV-2(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2,严重急性呼吸综合征冠状病毒2)。
二、病毒是怎么取名的?SARS-CoV-2跟SARS又有什么关系?
其实,按照目前的规定,一种新型病毒和它引发的疾病通常是由不同机构进行命名的:WHO负责新疾病的命名,ICTV负责新病毒的分类与命名(种属地位与学名)。虽然大多数时候,疾病名称会和对应的病原体保持一致(比如与登革热Dengue对应的登革热病毒Dengue virus,非典SARS对应的SARS冠状病毒SARS-CoV)。但有的时候会出现疾病和病毒的名字并不完全一致的情况,比如和艾滋病(AIDS)对应的艾滋病病毒HIV,以及此次的新冠病毒。
对于疾病的命名,其实并没有非常复杂的规则,WHO最新的相关文件是2015年提出的。
——在对新发现传染性疾病命名的指导原则中提到:
疾病名称应当包括疾病症状方面(比如呼吸道疾病、神经综合征、水样腹泻)的通用描述性术语和疾病表现、受影响人群、疾病严重性或者季节性特征等有力可得信息方面(比如进行性、青少年、严重、冬季)的更为具体的描述性术语。当已知引起疾病的病原体时,那么该病原体就应当被纳入疾病名称(比如冠状病毒、流感病毒、沙门氏菌)。
同时WHO还提倡使用中性、一般的术语代替人物、地点、动物、食物和职业的名称来命名,这是因为过去一些传染性疾病的名称曾导致污名化和其他不良后果:
在疾病名称中应当避免的术语包括地理方位(比如中东呼吸综合征、西班牙流感、裂谷热)、人名(比如克罗伊茨费尔特——雅各布病、恰加斯氏病)、动物或食物种群(猪流感、禽流感、猴痘)、涉及到文化、人口、工业或职业(如军团)和可煽动过度恐慌的术语(如不明、致命、流行)。
不过对于此次新冠病毒和疾病用不同名字的情况,WHO也在自己的官网进行了特别说明(见图1)。通常来说,病毒的命名更多的是基于病毒本身的遗传信息和结构,目的是为了更好地促进诊断方法、疫苗或者药品的研发过程。疾病的命名则是为了更方便地讨论疾病的预防、传播、严重性和治疗等相关问题。在此次疫情中,为了避免在交流中引起不必要的误会,WHO在描述此次新冠病毒时,会用“引起COVID-19疾病的病毒”或者“COVID-19病毒”这样的名字来描述(见图2)。

                               
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图1

                               
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图2
回到ICTV这边,ICTV之所以将这次的新的病毒命名为SARS-CoV-2也有自己的理由。ICTV2月11日第一次发表预印版论文将新冠病毒命名为SARS-CoV-2的时候提到:新病毒的命名是根据基因测序等方面的分类学研究的结果:基因测序等研究结果显示,新出现的这种冠状病毒与SARS冠状病毒同属冠状病毒科的β属冠状病毒。
三、科学家们为什么呼吁改名?新名字还有修改的机会吗?
新名字SARS-CoV-2公布不久就遭到了国内病毒学家们的反对,包括石正丽、高福在内的专家们认为,这个名字对于没有病毒学知识的科学家和普通民众有很高的误导性,并且提议将新病毒命名为Human coronavirus 2019 (HCoV-19)。
2月19日,我国科学家们发表在《柳叶刀》的通讯文章中,呼吁不使用SARS-CoV-2这个名字的原因总结起来有以下几点:
1、SARS是疾病名称,将新病毒命名为SARS-CoV-2会对一些病毒学知识不足的科学家及公众产生严重的误导,他们会认为新型病毒会导致SARS或类似疾病;
2、新病毒与SARS样或SARS相关冠状病毒不同,两种病毒的基因序列有差异;
3、新病毒在生物学、流行病学及临床特征方面与SARS病毒有区别,而且新名称也与疾病名称COVID-19不相符;
4、新病毒引发的疫情还在发展中,还远没有结束。新病毒可能会演变为一种低致病性、高传播性的冠状病毒,像季节性流感那样每年冬天卷土重来。鉴于新病毒引起的全球效应,理应有一个新的独立的名字。
也正是基于以上这些原因,我国学者提议新病毒应该被命名为HCoV-19。不过显然,对于以上理由,ICTV有自己的考量。
在本文开头所提到的最新发表的论文里,ICTV表示:
1、之前的病毒命名体系中,尤其是对于新病毒的命名,经常会加入首次发现感染动物,地点等信息,但是随着对新病毒了解到深入,比如发现了病毒能感染到新的物种或者新的病毒爆发的区域,旧的名字就会让人十分疑惑。ICTV 50年前成立的时候也是为了消除这个疑惑,在现有体系中,对新发现病毒的命名,更多是基于遗传学的信息。
2、基于现有的遗传序列相似度的命名体系中,SARS(严重急性呼吸综合征,对应病毒为SARS-CoV,病毒英文SARS-associated coronavirus)和MERS(中东呼吸综合征,对应病毒为MERS-CoV,病毒英文Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus)作为一个新物种的第一个被鉴定的代表,符合命名新种名的条件,但是对于新冠病毒来说,遗传分析证明它属于已经建立的病毒科属,不构成命名新种名的条件,目前已经发现它和SARS-CoV亲缘关系最近,所以可以将其归类为这一已知种,这也是新冠病毒被命名为SARS-CoV-2的主要原因。
3、ICTV也承认,两种病毒在疾病特点和传播方式上有很大的不同,为了更方便地交流,ICTV同时也提议用SARS-CoV-2/宿主/时间/病毒株/时间的方法来记录每一个被分离的病毒株。
所以尽管有争议,SARS-CoV-2这个名字恐怕要一直用下去了。
本文编辑:ambergchen


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